Les prunes sont dites noires en comparaison au prunes pas noires ! on utilise souvent le monochrome pour qualifier la différence (noir et blanc pour différentier un type de fruit foncé d'un autre plus clair)
Je pense que la réponse de Max est plus proche de la réalité que celle d'Adrien (et plus compréhensible)... Sinon pour ma part, je pense que c'est pour ne pas les confondre avec les les prunes vertes qui sont vertes lorsqu'elles sont verte...